С конца 90-х годов Ирина Анатольевна активно занималась общественно-политической и правозащитной деятельностью. С 2000 года являлась Председателем Самарского регионального отделения и членом Бюро Федерального Совета Российской демократической партии "ЯБЛОКО". В 2003 году баллотировалась в депутаты Государственной Думы РФ. И.А.Скупова являлась руководителем некоммерческого партнерства "Правовая помощь", оказывающего бесплатную юридическую помощь незащищенным слоям населения. По ее инициативе были созданы профильные общественные организации "ДОПУСК" – Добровольное Объединение потребителей услуг самарской коммуналки и "ДОСТУП" - организация по защите прав потребителей услуг телефонной связи.

И.А.Скупова известна в Самарской области как организатор различных образовательных и просветительских программ. В 80-е годы возглавляла Самарский общественный фонд инновации творческих технологий в образовании и обучении "СОФИТ". С февраля 2004 года она возглавляет Самарскую Школу публичной политики.

2 июля 2004 г. Ирина Анатольевна Скупова по результатам тайного голосования депутатами Самарской Губернской Думы на должность Уполномоченного по правам человека в Самарской области была назначена (Постановление Самарской Губернской Думы от 02.07.2004 г. № 1211). В настоящее время в соответствии с п.2 ст. 11 Закона Самарской области "Об Уполномоченном по правам человека в Самарской области" И.А.Скупова сложила все партийные полномочия.